Для запуска файла скпта написанного на языке Пайтон из 1С нужно:

1. Убедиться что на сервере установлени Пайтон. (windows +R в открывшимся окне набираем "Python" -  "ок" - должен открыться IDL Пайтон: 
2. В 1С, в сервеной процедуре пишем код:  где "ПутьКФайлуПайтон - Путь к файлу *.py который нужно запустить.

&НаСервере
Процедура ЗапускФрагмент()
	СтрокаЗАпуска = СтрШаблон("Python ""%1""", ПутьКФайлаПайтон); 
	ЗапуститьПриложение(СтрокаЗАпуска,,Истина); 
	Сообщить("Готово");
	
КонецПроцедуры